สารเมตาบอไลต์ IgA เซลล์ภูมิคุ้มกัน และไซโตไคน์ ปัจจัยเหล่านี้ทำงานร่วมกันเพื่อสร้างรูปร่างของจุลินทรีย์สำหรับทารกที่กินนมแม่และการตอบสนองของโฮสต์ต่อจุลินทรีย์เหล่านี้ ตัวอย่างเช่นบิฟิโดแบคทีเรียม ( Marcobal et al., 2010  Marcobal and Sonnenburg, 2012 ) จุลินทรีย์ การเคลื่อนย้ายของแบคทีเรียจากลำไส้ของหนูจะเพิ่มขึ้นในระหว่างตั้งครรภ์และให้นมบุตร และเซลล์เดนไดรต์ที่บรรจุแบคทีเรียในนมได้รับการเสนอให้มีส่วนร่วมในการประทับภูมิคุ้มกันของทารกแรกเกิดโดยมีอิทธิพลต่อธรรมชาติของการตอบสนองของภูมิคุ้มกันต่อแอนติเจนในส่วนกลาง