แม่น้ำเหลืองตอนล่างมีการเปลี่ยนแปลงเส้นทางอย่างรุนแรงตลอดประวัติศาสตร์ทางธรณีวิทยา ความลาดชัน และความเร็ว ที่ลดลงของแม่น้ำบนที่ราบทำให้ตะกอนที่แขวนลอยอยู่จับตัวกัน เมื่อแม่น้ำก่อตัวขึ้น กระแสน้ำจะเปลี่ยนเส้นทางไปสู่ระดับที่ต่ำกว่า ในช่วงสี่พันปีที่ผ่านมาแม่น้ำได้เข้าสู่ทะเลเหลืองณ จุดที่ห่างกันมากถึง 500 ไมล์ (800 กม.) ตั้งแต่สหัสวรรษที่ 3 ก่อน คริสต์ศักราช ถึง 602 ก่อนคริสตศักราช เมื่อมันครอบครองเส้นทางเหนือสุด มันไหลเข้า ใกล้ เมือง เทียนจินในปัจจุบัน แม่น้ำฮวงโห และเข้าสู่บ่อไห่ ที่อยู่ใกล้เคียง ตั้งแต่ 602 ก่อนคริสตศักราชถึง 70 ซีซีทั้งแม่น้ำและปากแม่น้ำก็เปลี่ยนไปยังจุดที่ทะเลเหลืองทางตอนใต้ของคาบสมุทรซานตง จากปี 70 ถึงปี 1048 แม่น้ำฮวงโหเคลื่อนตัวไปทางเหนืออีกครั้ง โดยเคลื่อนตัวไปทางเหนือใกล้กับเตียงปัจจุบัน  จากปี ค.ศ. 1048 ถึงปี ค.ศ. 1194 การเปลี่ยนแปลงในเส้นทางของแม่น้ำเกิดขึ้นไกลออก ไปในประเทศ ซึ่งแม่น้ำเข้าสู่ที่ราบจีนตอนเหนือ ในปี ค.ศ. 1194 แม่น้ำได้ครอบครองเส้นทางที่ไหลไปยังขอบด้านใต้ของสามเหลี่ยมปากแม่น้ำ ในปีนั้น หลังจากที่คันกั้นน้ำ ที่ป้องกันได้แตกออก แขนที่สองของแม่น้ำเหลืองก็เริ่มไหลไปทางใต้ของคาบสมุทรซานตง จากปี ค.ศ. 1289 ถึงปี ค.ศ. 1324 แม่น้ำได้ยึดครองแม่น้ำ Guo และส่วนใหญ่ของแม่น้ำฮ่วยเข้าสู่บ่อทะเลเหลืองทางตอนใต้ของซานตง มันมีเสถียรภาพมากว่า 500 ปี จนกระทั่งถึงปี 1850 เมื่อมันย้ายไปทางเหนือของคาบสมุทรซานตงอีกครั้ง ในที่สุดก็ตกลงสู่เส้นทางปัจจุบัน